Analyse de la composition microbienne de fromages par une approche de métagénomique ciblée en lien avec la présence de bactériophages de bactéries d’affinage.

• Stage d'étudiant.e en licence de biologie ou en BUT Génie Biologique 
• Lieu : unité SayFood, Campus Agro Paris-Saclay à Palaiseau (91120)
• Durée du stage : 3 à 6 mois
• Début du stage : 2e trimestre 2026 
• Clôture des candidatures : 14 février 2026

Contexte : L’objectif du projet SURPHAGES, dans lequel s’intègre le stage, est d’établir une vaste collection de bactériophages qui infectent des bactéries d’affinage à partir d’échantillons de fromages, et d’étudier leur diversité. Les bactériophages sont des virus qui infectent spécifiquement des bactéries. Leur présence dans l’environnement de production pourrait avoir un effet non négligeable sur le développement de certaines bactéries d’intérêt technologique et ainsi impacter la qualité des produits.

Missions : 

• Extraire l’ADN microbien à partir des échantillons de fromage 
• Amplifier les marqueurs phylogénétiques (gène codant pour l’ARNr16S et région ITS) par PCR
•  Analyser les résultats de séquençage (métagénomique ciblée)

Pour candidater : transmettre votre candidature (CV et lettre de motivation) à :

Eric Dugat-bony, eric.dugat-bony@inrae.fr et Margareth Renault, margareth.renault@inrae.fr

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